《海峡西岸科技协作联盟协议书》提出：构建科技协作联盟是福建省发挥对台区域优势，加强海峡西岸省市科技资源整合，夯筑对台前沿科技交流协作平台的重要举措。８省市科技行政部门议定从以下方面加强海峡两岸科技交流协作：

    密切海峡两岸的学术交流，科技部和福建省每年定期举办“海西科技论坛”，探索建立海峡两岸科技人员和科技管理人员交流、柔性流动的有效机制，鼓励联盟成员共同与台湾开展科技合作、考察。

    研究建立海峡西岸经济区域与台湾科技资源合作共享机制，探索建立对台区域产业技术重点研发基地，组织开展区域产业的重大共性、关键性技术联合攻关。

    促进海峡两岸科技产业对接，针对台湾电子技术、生物技术、机械制造、农业产业等在国际上具有较强竞争力的优势，加强海峡西岸经济区域与台湾产业对接。推进科技资源开放与共享，共同建设海峡西岸经济区域科技信息资源共享服务平台。联合举办科技博览会、交易会、项目推介会等。